Eclipse EGit e git na linha de comando mostram diferentes status

No meu repositório git eu posso fazer o status git e ele me diz que tudo está atualizado:

<code>[598] : git status
# On branch master
nothing to commit (working directory clean)
</code>

Se eu me conectar ao repositório com EGit e fizer uma sincronização no Eclipse eu recebo:

De alguma forma, o EGit acha que muitos arquivos foram removidos e lidos com o mesmo nome. Como o status do git não retorna nada para commitar, espero obter uma janela vazia aqui.

Para completar: Isso é no OSX 10.7, mas eu vi o mesmo problema no Windows 7 Pro também.

Alguma idéia do que está acontecendo aqui?

questionAnswers(1)

yourAnswerToTheQuestion