Descobri que uma solução para muitas das minhas perguntas não respondidas era executar um script perl no código para executar algumas mudanças que são difíceis de serem feitas com regexs ou musch mais simples do que alguns conselhos que consegui conectar ao DalVik.

Então isso vai ser umpergunta auto-respondida Eu lhe contei como consegui,passo a passo. Espero que isso ajude as pessoas a resolver alguns dos seus problemas.