¿Cómo copiar parcialmente usando Python un archivo Hdf5 en uno nuevo manteniendo la misma estructura?

Tengo un gran archivo hdf5 que se parece a esto: A/B/dataset1, dataset2 A/C/dataset1, dataset2 A/D/dataset1, dataset2 A/E/dataset1, dataset2... Quiero crear un nuevo archivo solo con eso: A / B / dataset1, dataset2 A / C / dataset1, ...

Cómo sobrescribir la matriz dentro del archivo h5 usando h5py

Estoy tratando de sobrescribir una matriz numpy que es una pequeña parte de un archivo h5 bastante complicado. Estoy extrayendo una matriz, cambiando algunos valores, luego quiero volver a insertar la matriz en el archivo h5. No tengo problemas ...

h5py: forma correcta de cortar conjuntos de datos de matriz

Estoy un poco confundido aquí: Por lo que he entendido, h5py's.value El método lee un conjunto de datos completo y lo descarga en una matriz, que es lenta y desaconsejada (y generalmente debe reemplazarse por[()]. La forma correcta es usar un ...

Conjunto de datos HDF5 creado por Python transpuesto en Matlab

Tengo algunos datos que comparto entre Python y Matlab. Solía hacerlo guardando matrices NumPy en archivos .mat de estilo MATLAB, pero me gustaría cambiar a conjuntos de datos HDF5. Sin embargo, noté una característica divertida: cuando guardo ...

Entradas y salidas de arrays numpy a h5py

¿Cómo establecer la configuración de la memoria caché utilizando la interfaz de alto nivel h5py?

Estoy intentando aumentar el tamaño del caché para mis archivos HDF5, pero no parece estar funcionando. Esto es lo que tengo:

Compruebe si el nodo existe en h5py

¿Pasar el archivo hdf5 a h5py como binario blob / cadena?

Python HDF5 H5Py emite problemas al abrir varios archivos

Estoy usando la versión de 64 bits de Enthought Python para procesar datos en múltiples archivos HDF5. Estoy usando h5py versión 1.3.1 (HDF5 1.8.4) en Windows de 64 bits. Tengo un objeto que proporciona una interfaz conveniente para mi ...

Instalar h5py en OS X

He pasado el día tratando de obtener elh5py módulo de python funcionando, pero sin éxito. Instalé bibliotecas compartidas HDF5, seguí las instrucciones que pude encontrar en la web para hacerlo bien. Pero no funciona, a continuación se muestra ...