Resultados de la búsqueda a petición "bioinformatics"
Agrupando datos ecológicos en R
Estoy viendo algunos datos ecológicos (dieta) y tratando de averiguar cómo agrupar por Predator. Me gustaría poder extraer los datos para poder ver los pesos...
Retire parte de la cuerda después de "."
Estoy trabajando con números de acceso de secuencia de referencia NCBI como variable
Pyparsing: extracción de longitud variable, contenido variable, subcadena de espacios en blanco variable
Necesito extraer las puntuaciones de Gleason de un archivo plano de los diagnósticos diagnósticos finales de prostatectomía. Estas puntuaciones siempre tiene...
Bash: reemplazar parte del nombre del archivo
Tengo un comando que quiero ejecutar en todos los archivos de una carpeta, y la sintaxis del comando se ve así: tophat -o <output_file> <input_file>Lo que me gustaría hacer es un script que recorra todos los archivos en una carpeta arbitraria y ...
Procesamiento de trama de datos
Tengo un marco de datos, que leí porMatch <- read.table("Match.txt", sep="", fill =T, stringsAsFactors = FALSE, quote = "", header = F) y se ve así: > ab V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 1 Inspecting sequence ID chr1:173244300-173244500 NA NA 2 ...
Lectura en archivo bloque por bloque usando el delimitador especificado en python
Tengo un archivo input_file.fa como este (FASTA [https://en.wikipedia.org/wiki/FASTA_format]formato): > header1 description data data data >header2 description more data data data Quiero leer en el archivo un fragmento a la vez, para que cada ...
WinError 2 El sistema no puede encontrar el archivo especificado (Python)
Tengo un programa Fortran y quiero ejecutarlo en Python para múltiples archivos. Tengo 2000 archivos de entrada, pero en mi código Fortran solo puedo ejecutar un archivo a la vez. ¿Cómo debo llamar al programa Fortran en python? Mi ...
Examples for Topological Sorting on Large DAGs
Busco aplicaciones del mundo real donde clasificación topológica se realiza en grande gráfico tamaños. Algunos campos donde imagino que podría encontrar tales instancias serían bioinformática, resolución de dependencia, bases de datos, diseño ...
Consultando los registros del servicio DNS para encontrar el nombre de host y TCP / IP
En un artículo sobre elLife Science Identifiers (verLSID Tester, una herramienta para probar los servicios de resolución del Identificador de Ciencias de la Vida [http://www.scfbm.org/content/3/1/2]), El Dr. Roderic DM Page escribió: Dado la ...
Cómo llamar al módulo escrito con argparse en el cuaderno iPython
Estoy tratando de pasar secuencias de BioPython aLa implementación de Ilya Stepanov del algoritmo del árbol de sufijos de Ukkonen [https://gist.github.com/istepanov/6506508#file-lcs-py]en el entorno portátil de iPython. Estoy tropezando con el ...