Resultados de la búsqueda a petición "biopython"
Cómo llamar al módulo escrito con argparse en el cuaderno iPython
Estoy tratando de pasar secuencias de BioPython aLa implementación de Ilya Stepanov del algoritmo del árbol de sufijos de Ukkonen [https://gist.github.com/istepanov/6506508#file-lcs-py]en el entorno portátil de iPython. Estoy tropezando con el ...
Existe una función que pueda calcular una puntuación para secuencias alineadas dados los parámetros de alineación?
Intento puntuar las secuencias ya alineadas. Digamo seq1 = 'PAVKDLGAEG-ASDKGT--SHVVY----------TI-QLASTFE' seq2 = 'PAVEDLGATG-ANDKGT--LYNIYARNTEGHPRSTV-QLGSTFE'con los parámetros dados substitution matrix : blosum62 gap open penalty : -5 gap ...
Instalación de biopython - python 3.3 no encontrada en el registro
Estoy intentando instalar biopython para ejecutarse con Python 3.3 en una computadora con Windows7.He descargado el biopython ejecutable biopython-1.61.win32...
¿Cómo puedo combinar cadenas superpuestas en Python?
Tengo algunas cuerdas ['SGALWDV', 'GALWDVP', 'ALWDVPS', 'LWDVPSP', 'WDVPSPV']Estas cadenas se superponen parcialmente entre sí. Si los superponía manualmente, obtendría: SGALWDVPSPVQuiero una manera de pasar de la lista de cadenas superpuestas ...
Cómo encontrar un marco de lectura abierto en Python
Estoy usando Python y una expresión regular para encontrar un
return fuera de la función [cerrado]
Hii Recibo el siguiente error en Biopython: 'return' fuera de la función (nombre de archivo ... línea 26) A continuación se muestra el código de mi archivo POR FAVOR AYUDA # File Name RandonProteinSequences.py # standard library import os import ...