¿Cuál es la diferencia entre clonar y copiar un repositorio de git?

Losa misma pregunta existe para mercurial, y me pregunto cómo se aplica esto a git? En particular, me interesan los casos en los que hay dos repositorios locales y la copia entre servidores usando rsync o similares.

Además, si el repositorio original se clona a sí mismo, digamos gitorious, y lo copio, entonces gitorious seguirá existiendo como un control remoto (rastreado por la rama maestra) en la copia, ¿verdad? ¿Esto sucede si la copia se clona en su lugar?

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