Uso el método Peek () de StreamReader para verificar si hay más líneas que deben procesarse. Hay más de 1000 líneas en mi archivo, pero Peek () de repente devuelve -1 cuando llega a la línea # 750. Lo comprobé pero parece que no hay diferencias entre la línea # 750 y la # 751. Incluso eliminé la línea # 750 y 751, todavía se dividirá en otra línea.

Abajo están mis códigos para su información:

try
{
    String ftpserver = ftp + filename;
    reqFTP = (FtpWebRequest)FtpWebRequest.Create(new Uri(ftpserver));
    reqFTP.UsePassive = false;
    reqFTP.UseBinary = true;
    reqFTP.Proxy = null;
    reqFTP.Credentials = new NetworkCredential(username, password);

    reqFTP.Method = WebRequestMethods.Ftp.DownloadFile;
    response = (FtpWebResponse)reqFTP.GetResponse();
    stream = response.GetResponseStream();
    reader = new StreamReader(stream, ConfigHelper.MyEncoding);
    while (reader.Peek() > -1)
    {
        string x = reader.ReadLine();
        if (x != null)
        {
          //.......
         }
    }
}
catch (Exception ex)
{
}
finally
{
    if (reader != null)
        reader.Close();
    if (response != null)
        response.Close();
}

Lo intentéwhile ((x = reader.ReadLine()) != null), pero se descartó una excepción de "No se puede acceder a un objeto desechado".

Finalmente lo descubrí usando:while (stream.CanRead && (x = reader.ReadLine()) != null)