Estoy tratando de analizar datos de stdin en modo binario en Win32. Lo primero que hace mi código es verificar un encabezado de 4bytes al principio:

int riff_header;
fread(&riff_header, sizeof(riff_header), 1, ifp);
//  'RIFF' = little-endian
if (riff_header != 0x46464952) {
    fprintf(stderr, "wav2msu: Incorrect header: Invalid format or endianness\n");
    fprintf(stderr, "         Value was: 0x%x\n", riff_header);
    return -1;
}

stdin se ha cambiado al modo binario antes de leerlo:

if (*argv[argc-1] == '-') {
    fprintf(stderr, "Reading from stdin.\n");
    infile = stdin;
    // We need to switch stdin to binary mode, or else we run
    // into problems under Windows
    freopen(NULL, "rb", stdin);
}

Este código funciona bien en Linux, sin embargo, en Win32 (específicamente Windows XP), elfread solo parece leer un solo byte y, por lo tanto, hace que la evaluación falle. Ejemplo

> ffmeg.exe -i ..\test.mp3 -f wav pipe:1 2> nul |..\foo.exe -o test.bin -
Reading from stdin.
foo: Incorrect header: Invalid format or endianness
     Value was: 0x4

¿Qué estoy haciendo mal