Es posible con las herramientas de Git mover archivos a una nueva carpeta mientras se modifica su historial completo, como si los archivos hubieran estado allí desde su primer agregado?

e me ocurrió esto después de fusionar algunos repositorios: moví los archivos de varios repositorios a carpetas distintas dentro de un "super" repositorio, sin embargo, el historial combinado se comporta muy mal congit rebase ygit svn herramientas, ya que los archivos totalmente diferentes pueden colisionar en sus antiguas ubicaciones, por supuesto.