Error aleatorio NoClassDefFound en aplicación web

Preguntándose si algún gurú podría arrojar una idea de por qué sucede lo siguiente al azar.

Tenemos una aplicación web que implementamos en Jetty 6.1.26 que se ejecuta en una instalación de Linux con JRE 1.7_03

No siempre, pero de vez en cuando, cuando Jetty se inicia, lo que parece ser una clase aleatoria (de nuestro proyecto) parece ser la fuente de un error NoClassDefFound. Si reiniciamos Jetty el problema desaparece.

El único patrón que ocurre parece ser que las clases en la raíz del error se completan a través de las anotaciones de JAXB.

Para dar una idea más de la frecuencia, se siente que esto sucede 1/50 veces, si es eso

Me interesaría saber cómo y por qué para este error.

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