Aquí hay un ejemplo de trabajo mínimo.

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date : 2018-May-26
output:
    pdf_document
title: "Testing Rmarkdown"
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```{r,comment = NA}

Gender <- gl(2,1000,labels = c("Men","Women"))
SmokerM <- sample(c("Y","N"),1000,replace = T , prob = c(.3,.7))
SmokerW <- sample(c("Y","N"),1000,replace = T , prob = c(.5,.5))
Smoker <- c(SmokerM,SmokerW)

mydata  <- data.frame(Gender,Smoker)
table(mydata$Gender,mydata$Smoker)

```

This is a text in the body of the document.What font is this ? What is
font for the output of table ? How can we change these 2 fonts ? What 
other categories of items are there in an Rmarkdown which have different
fonts ?       

Mi consulta es la siguiente: ¿Cuáles son las fuentes predeterminadas para un documento de Rmarkdown y cómo puedo cambiarlas?

Mientras investigaba esto me encontré con esta página:

[Variables de Pandoc] [1]http: //pandoc.org/MANUAL.html#variables-for-late

¿Es correcto que haya 4 fuentes (mainfont / sansfont / monofont / mathfont) para describir 4 categorías de salida en Rmarkdown? ¿Cuáles son sus valores predeterminados y cómo puedo cambiarlos?