Spark no funciona con pureconfig

Estoy tratando de usar pureConfig y configFactory para la configuración de mi aplicación spark. Aquí está mi código:

import pureconfig.{loadConfigOrThrow}
object Source{
  def apply(keyName: String, configArguments: Config): Source = {
    keyName.toLowerCase match {
      case "mysql" =>
          val properties = loadConfigOrThrow[DBConnectionProperties](configArguments)
          new MysqlSource(None, properties)
      case "files" =>
        val properties = loadConfigOrThrow[FilesSourceProperties](configArguments)
        new Files(properties)
      case _ => throw new NoSuchElementException(s"Unknown Source ${keyName.toLowerCase}")
    }

  }
}

import Source
val config = ConfigFactory.parseString(result.mkString("\n"))
    val source = Source("mysql",config.getConfig("source.mysql"))

cuando lo ejecuto desde el IDE (intelliJ) o directamente desde java (es decir, java jar ...) funciona bien.

Pero cuando lo ejecuto con spark-submit falla con el siguiente error:

Exception in thread "main" java.lang.NoSuchMethodError: shapeless.Witness$.mkWitness(Ljava/lang/Object;)Lshapeless/Witness;

De una búsqueda rápida encontré un similar similar a estepregunta. lo que sugiere que la razón de esto se debe al hecho de que spark y pureConfig dependen de Shapeless pero con diferentes versiones,

lo intentésombrearlo como se sugiere en la respuesta

assemblyShadeRules in assembly := Seq(
  ShadeRule.rename("shapeless.**" -> "shadeshapless.@1")
    .inLibrary("com.github.pureconfig" %% "pureconfig" % "0.7.0").inProject
)

pero no funcionó tan bien, ¿puede ser por una razón diferente? alguna idea de lo que puede funcionar?

Gracias

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