Cómo cambiar el nombre del paquete de una aplicación de Android

Mi almacén de claves está dañado, por lo tanto, Android Market me exige que cambie el nombre de la aplicación y la vuelva a enviar. Sin embargo, cada vez que voy a editar los nombres de los paquetes en Manifiesto y en todos los archivos, me da muchos errores.

¿Cuál es la forma correcta de cambiar el nombre de la aplicación?

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