Cómo pasar información MPI a ctypes en python
Mi motivación es pasar la información MPI efectivamente de python a las funciones C invocadas a través de ctypes. Utilicé mpi4py para enlaces MPI en python. Me gustaría aprenderlo a través de un ejemplo simple de código MPI escrito en C e invocado a través de ctypes en python. He detallado los pasos y el error que obtengo mientras corro a continuación.
Codigo c [passMpi4Py.c]
#include <stdio.h>
#include <mpi.h>
void sayhello(MPI_Comm comm)
{
int size, rank;
MPI_Comm_size(comm, &size);
MPI_Comm_rank(comm, &rank);
printf("Hello, World! "
"I am process %d of %d.\n",
rank, size);
}
Compilé el código c anterior con gcc / openmpi-1.6 de la siguiente manera:
mpicc -shared -Wl, -soname, passMpi4Py -o passMpi4Py.so -fPIC passMpi4Py.c
Envoltura de pitón [passMpi4PyWrapper.py]
import ctypes
from mpi4py import MPI
testlib = ctypes.CDLL('path-to-file/passMpi4Py/passMpi4Py.so')
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
Cuando intento ejecutar el código anterior usando
mpirun -np 4 python passMpi4PyWrapper.py
Obtuve el siguiente error
Traceback (most recent call last):
Traceback (most recent call last):
File "passMpi4PyWrapper.py", line 5, in <module>
Traceback (most recent call last):
File "passMpi4PyWrapper.py", line 5, in <module>
File "passMpi4PyWrapper.py", line 5, in <module>
Traceback (most recent call last):
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
ctypes.ArgumentError: argument 1: <type 'exceptions.TypeError'>: Don't know how to convert parameter 1
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
ctypes.ArgumentError: argument 1: <type 'exceptions.TypeError'>: Don't know how to convert parameter 1
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
ctypes.ArgumentError: argument 1: <type 'exceptions.TypeError'>: Don't know how to convert parameter 1
File "passMpi4PyWrapper.py", line 5, in <module>
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
ctypes.ArgumentError: argument 1: <type 'exceptions.TypeError'>: Don't know how to convert parameter 1
Actualizar:
Usando * MPI_COMM_WORLD * en lugar decom En el programa C, las funciones MPI me ayudan a eliminar el error. Sin embargo, todavía me gustaría saber si esta es la mejor manera posible de pasar la información de MPI a un programa en C.