So übergeben Sie MPI-Informationen an ctypes in Python
Meine Motivation ist es, MPI-Informationen effektiv von Python an C-Funktionen zu übergeben, die über ctypes aufgerufen werden. Ich habe MPI4PY für MPI-Bindungen in Python verwendet. Ich möchte es anhand eines einfachen Beispiel-MPI-Codes lernen, der in C geschrieben und in Python über ctypes aufgerufen wurde. Ich habe die Schritte und den Fehler, den ich beim Ausführen bekomme, unten detailliert beschrieben.
C-Code [passMpi4Py.c]
#include <stdio.h>
#include <mpi.h>
void sayhello(MPI_Comm comm)
{
int size, rank;
MPI_Comm_size(comm, &size);
MPI_Comm_rank(comm, &rank);
printf("Hello, World! "
"I am process %d of %d.\n",
rank, size);
}
Ich habe den obigen c-Code mit gcc / openmpi-1.6 wie folgt kompiliert:
mpicc -shared -Wl, -soname, passMpi4Py -o passMpi4Py.so -fPIC passMpi4Py.c
Python-Wrapper [passMpi4PyWrapper.py]
import ctypes
from mpi4py import MPI
testlib = ctypes.CDLL('path-to-file/passMpi4Py/passMpi4Py.so')
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
Wenn ich versuche, den obigen Code unter Verwendung von auszuführen
mpirun -np 4 python passMpi4PyWrapper.py
Ich erhalte den folgenden Fehler
Traceback (most recent call last):
Traceback (most recent call last):
File "passMpi4PyWrapper.py", line 5, in <module>
Traceback (most recent call last):
File "passMpi4PyWrapper.py", line 5, in <module>
File "passMpi4PyWrapper.py", line 5, in <module>
Traceback (most recent call last):
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
ctypes.ArgumentError: argument 1: <type 'exceptions.TypeError'>: Don't know how to convert parameter 1
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
ctypes.ArgumentError: argument 1: <type 'exceptions.TypeError'>: Don't know how to convert parameter 1
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
ctypes.ArgumentError: argument 1: <type 'exceptions.TypeError'>: Don't know how to convert parameter 1
File "passMpi4PyWrapper.py", line 5, in <module>
testlib.sayhello(MPI.COMM_WORLD)
ctypes.ArgumentError: argument 1: <type 'exceptions.TypeError'>: Don't know how to convert parameter 1
Aktualisieren:
Verwenden Sie * MPI_COMM_WORLD * anstelle voncomm im C-Programm helfen mir MPI-Funktionen, den Fehler zu beheben. Ich würde jedoch gerne wissen, ob dies der beste Weg ist, MPI-Informationen an ein C-Programm zu übergeben.