Bien, entonces creo que debería haber una manera fácil de crear un diagrama de dispersión tridimensional usando matplotlib. Tengo una matriz numpy 3D (dset) con 0 es donde no quiero un punto y 1 donde hago, básicamente para trazarlo ahora tengo que pasar por tresfor: bucles como tales:

for i in range(30):
    for x in range(60):
        for y in range(60):
            if dset[i, x, y] == 1:
                ax.scatter(x, y, -i, zdir='z', c= 'red')

¿Alguna sugerencia sobre cómo podría lograr esto de manera más eficiente? Cualquier idea sería apreciada grandemente