Swagger anula las anotaciones de ruta

Acabo de recibir swagger para producir un swagger.json válido. Configuré swagger usando el método Application-config. Sin embargo, tan pronto como anulo el método getClasses para agregar los recursos de swagger, mis clases anotadas JAX-RS Path dejan de funcionar. El método se ve así

@Override
public Set<Class<?>> getClasses() {
    Set<Class<?>> resources = new HashSet<>();

    resources.add(io.swagger.jaxrs.listing.ApiListingResource.class);
    resources.add(io.swagger.jaxrs.listing.SwaggerSerializers.class);

    return resources;
}

e invocar super.getClasses () devuelve un conjunto vacío. Obtuve demasiados recursos en mi proyecto, que no me gustaría agregar manualmente.

¿Hay alguna forma en que swagger no se meta con mi configuración anterior?

¡Gracias!