modificando el ejemplo de gráfico de fuerza dirigida d3

Soy nuevo en javascript y D3.js, y estoy tratando de entender cómo funciona todo. He estado jugando con el ejemplo gráfico de fuerza dirigida aquí:http://bl.ocks.org/mbostock/4062045

Lo que quiero hacer es cambiar los enlaces JSON de ser números de matriz a nombres de nodo. Estoy tratando de visualizar una pequeña topología de red, y tengo los nodos vecinos configurados. Aquí están los datos JSON que me gustaría usar:

{
  "nodes":[
    {"name":"stkbl0001","group":1},
    {"name":"stkbl0002","group":1},
    {"name":"stkbl0003","group":1},
    {"name":"stkbl0004","group":1},
    {"name":"stkbl0005","group":1}
  ],
  "links":[
    {"source":"stkbl0001","target":"stkbl0005","value":3},
    {"source":"stkbl0002","target":"stkbl0005","value":3},
    {"source":"stkbl0003","target":"stkbl0005","value":3},
    {"source":"stkbl0004","target":"stkbl0005","value":3}
  ]

Realmente no sé cómo alterar el código D3 para unir todo esto. No veo la sección donde los números de la matriz se obtienen y se pegan como enlaces. Esta es probablemente una pregunta estúpida, ¡pero me ayudará mucho!

EDITAR:

Aquí está el código de JavaScript que tengo hasta ahora basado en la entrada de Lars Kotthoff:

<!DOCTYPE html>
<meta charset="utf-8">
<style>

.node {
  stroke: #fff;
  stroke-width: 1.5px;
}

.link {
  stroke: #999;
  stroke-opacity: .6;
}

</style>
<body>
<script src="http://d3js.org/d3.v3.min.js"></script>
<script>

var width = 960,
    height = 500;

var color = d3.scale.category20();

var force = d3.layout.force()
    .charge(-120)
    .linkDistance(30)
    .size([width, height]);

var svg = d3.select("body").append("svg")
    .attr("width", width)
    .attr("height", height);

d3.json("mini.json", function(error, graph) {
  force
      .nodes(graph.nodes)
      .links(graph.links)
      .start();

  var link = svg.selectAll(".link")
      .data(graph.links)
      .enter().append("line")
      .attr("class", "link")
      .style("stroke-width", function(d) { return Math.sqrt(d.value); });

  var node = svg.selectAll(".node")
      .data(graph.nodes)
      .enter().append("circle")
      .attr("class", "node")
      .attr("r", 5)
      .style("fill", function(d) { return color(d.group); })
      .call(force.drag);

  var nodeMap = {};
  nodes.forEach(function(d) { nodeMap[d.name] = d; });

  links.forEach(function(l) {
      l.source = nodeMap[l.source];
      l.target = nodeMap[l.target];
  })

  node.append("title")
      .text(function(d) { return d.name; });

  force.on("tick", function() {
    link.attr("x1", function(d) { return d.source.x; })
        .attr("y1", function(d) { return d.source.y; })
        .attr("x2", function(d) { return d.target.x; })
        .attr("y2", function(d) { return d.target.y; });

    node.attr("cx", function(d) { return d.x; })
        .attr("cy", function(d) { return d.y; });
  });
});
</script>

Esto falla en la línea 55 (node.forEach (function (d) {nodeMap [d.name] = d;});) con el error:

Uncaught ReferenceError: nodes is not defined

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