De acuerdo aesta podemos obtener etiquetas para grupos no singleton.

Intenté esto con un simple ejemplo.

import numpy as np
import scipy.cluster.hierarchy
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage

mat = np.array([[ 0. , 1. , 3.  ,0. ,2.  ,3.  ,1.],
 [ 1. , 0. , 3. , 1.,  1. , 2. , 2.],
 [ 3.,  3. , 0.,  3. , 3.,  3. , 4.],
 [ 0. , 1. , 3.,  0. , 2. , 3.,  1.],
 [ 2. , 1.,  3. , 2.,  0. , 1.,  3.],
 [ 3. , 2.,  3. , 3. , 1. , 0. , 3.],
 [ 1. , 2.,  4. , 1. , 3.,  3. , 0.]])

def llf(id):
    if id < n:
        return str(id)
    else:
        return '[%d %d %1.2f]' % (id, count, R[n-id,3])


linkage_matrix = linkage(mat, "complete")

dendrogram(linkage_matrix,
           p=4,
           leaf_label_func=llf,
           color_threshold=1,
           truncate_mode='lastp',
           distance_sort='ascending')

plt.show()

¿Qué son n, y cuentan aquí? En un diagrama como el siguiente, necesito saber quiénes se enumeran en (3) y (2).