Una NA en el subconjunto de un data.frame hace algo inesperado

Considere el siguiente código. Cuando no prueba explícitamenteNA en su condición, ese código fallará en una fecha posterior y luego sus datos cambiarán.

>   # A toy example
>   a <- as.data.frame(cbind(col1=c(1,2,3,4),col2=c(2,NA,2,3),col3=c(1,2,3,4),col4=c(4,3,2,1)))
>   a
  col1 col2 col3 col4
1    1    2    1    4
2    2   NA    2    3
3    3    2    3    2
4    4    3    4    1
>   
>   # Bummer, there's an NA in my condition
>   a$col2==2
[1]  TRUE    NA  TRUE FALSE
> 
>   # Why is this a good thing to do?
>   # It NA'd the whole row, and kept it
>   a[a$col2==2,]
   col1 col2 col3 col4
1     1    2    1    4
NA   NA   NA   NA   NA
3     3    2    3    2
>   
>   # Yes, this is the right way to do it
>   a[!is.na(a$col2) & a$col2==2,]
  col1 col2 col3 col4
1    1    2    1    4
3    3    2    3    2
>     
>   # Subset seems designed to avoid this problem
>   subset(a, col2 == 2)
  col1 col2 col3 col4
1    1    2    1    4
3    3    2    3    2

¿Puede alguien explicar por qué el comportamiento que se obtiene sin elis.na ¿Alguna vez el control sería bueno o útil?

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