Cuando me encontré con brew doctor me voy cargado de advertencias. Así que seguí adelante, limpié la instalación existente y lo hice desde cero.

Ahora todavía recibo algunas advertencias:

    Warning: "config" scripts exist outside your system or Homebrew directories.
`./configure` scripts often look for *-config scripts to determine if
software packages are installed, and what additional flags to use when
compiling and linking.

Having additional scripts in your path can confuse software installed via
Homebrew if the config script overrides a system or Homebrew provided
script of the same name. We found the following "config" scripts:

    /opt/sm/pkg/active/bin/curl-config
    /opt/sm/pkg/active/bin/ncurses5-config
    /opt/sm/pkg/active/bin/ncursesw5-config
    /opt/sm/pkg/active/bin/pkg-config
    /opt/sm/pkg/active/bin/xml2-config
    /opt/sm/pkg/active/bin/xslt-config
Warning: You have a non-Homebrew 'pkg-config' in your PATH:
  /opt/sm/pkg/active/bin/pkg-config

`./configure` may have problems finding brew-installed packages using
this other pkg-config.

Pero como solo empecé a usar OS X hace unos días, no estoy seguro si los archivos de configuración mencionados son relevantes o si puedo eliminarlos. Ya he estado buscando en los foros durante horas, pero todavía no lo sé, por el momento ... ¡Cualquier consejo es muy apreciado!