Sql Schema Compare no se actualizará después de que se haya instalado el objeto CLR 'Se detectó un cambio en el origen del esquema'
Después de instalar un objeto CLR personalizado, Sql Server Developer Tools (SSDT) VS2012 no permitirá una actualización. El error es "Se detectó una desviación del esquema de origen. Presione Comparar para actualizar. Después de la actualización, ocurre lo mismo.
Probado en la configuración, configuro el objeto solo para procedimientos almacenados. Configuraciones -> General -> Bloquear en la posible pérdida de datos -> intentado encendido y apagado.