¿Cómo establecer permisos de archivo predeterminados en Aptana Studio 3?

Cada vez que subo un archivo al host remoto e intento abrirlo, aparece el mensaje "Error interno del servidor" y los permisos de los archivos se configuran en "666", que debe ser "644" para abrirse. ¿Cómo configuro los permisos de archivo predeterminados para que se configuren en "644"?

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