Mehrere Dateien mit unterschiedlichen Zählwerten kombinieren
Ich möchte 96 Dateien kombinieren, indem ich die zweite Spalte aus jeder Datei nehme und die erste Spalte behalte, die für alle Dateien gleich ist. Ich habe versucht, dies in R zu tun, aber ich dachte, es wäre besser im Terminal. Funktioniert es mit awk?
Beispieldaten
DMED7013:Rfam robinm$ head Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput402R.sam
Seq_../trimmed/402R.tally.fasta __not_aligned
__too_low_aQual 3
mir-10 5
Y_RNA 4
__too_low_aQual 0
__too_low_aQual 0
__not_aligned 1
mir-8 2
mir-671 3
mir-671 16
Die Dateien
DMED7013:Rfam robinm$ ls -l
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1711388 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput100G.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1712778 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput100R.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1709703 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput106G.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1707486 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput106R.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1704757 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput122G.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1705471 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput122R.sam
.....