Объедините несколько файлов с разными значениями количества
Я хотел бы объединить 96 файлов, взяв второй столбец из каждого файла и сохранить первый столбец, который одинаков для всех файлов. Я пытался сделать это в R, но подумал, что это будет лучше в терминале. Работает ли это с использованием awk?
Пример данных:
DMED7013:Rfam robinm$ head Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput402R.sam
Seq_../trimmed/402R.tally.fasta __not_aligned
__too_low_aQual 3
mir-10 5
Y_RNA 4
__too_low_aQual 0
__too_low_aQual 0
__not_aligned 1
mir-8 2
mir-671 3
mir-671 16
Файлы:
DMED7013:Rfam robinm$ ls -l
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1711388 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput100G.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1712778 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput100R.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1709703 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput106G.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1707486 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput106R.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1704757 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput122G.sam
-rw-r--r-- 1 robinm staff 1705471 Sep 22 19:12 Rfam_Counts_combined_SplitRfam_Counts_combinedhtseq_Rfamoutput122R.sam
.....