Wie kann ich die Gruppen aus diesem regulären Ausdruck aus einem Dateiobjekt (data.txt) extrahieren?

import numpy as np
import re
import os
ifile = open("data.txt",'r')

# Regex pattern
pattern = re.compile(r"""
                ^Time:(\d{2}:\d{2}:\d{2})   # Time: 12:34:56 at beginning of line
                \r{2}                       # Two carriage return
                \D+                         # 1 or more non-digits
                storeU=(\d+\.\d+)
                \s
                uIx=(\d+)
                \s
                storeI=(-?\d+.\d+)
                \s
                iIx=(\d+)
                \s
                avgCI=(-?\d+.\d+)
                """, re.VERBOSE | re.MULTILINE)

time = [];

for line in ifile:
    match = re.search(pattern, line)
    if match:
        time.append(match.group(1))

Das Problem im letzten Teil des Codes ist, dass ich zeilenweise iteriere, was bei mehrzeiligem Regex offensichtlich nicht funktioniert. Ich habe versucht zu verwendenpattern.finditer(ifile) so was:

for match in pattern.finditer(ifile):
    print match

... nur um zu sehen, ob es funktioniert, aber die Finditer-Methode benötigt einen String oder Puffer.

Ich habe diese Methode auch ausprobiert, kann sie aber nicht zum Laufen bringen

matches = [m.groups() for m in pattern.finditer(ifile)]

Irgendeine Idee?

Nach einem Kommentar von Mike und Tuomas wurde mir gesagt, ich solle .read () verwenden.

ifile = open("data.txt",'r').read()

Dies funktioniert einwandfrei, aber wäre dies der richtige Weg, um die Datei zu durchsuchen? Ich kann es nicht zum Laufen bringen ...

for i in pattern.finditer(ifile):
    match = re.search(pattern, i)
    if match:
        time.append(match.group(1))

Lösung

# Open file as file object and read to string
ifile = open("data.txt",'r')

# Read file object to string
text = ifile.read()

# Close file object
ifile.close()

# Regex pattern
pattern_meas = re.compile(r"""
                ^Time:(\d{2}:\d{2}:\d{2})   # Time: 12:34:56 at beginning of line
                \n{2}                       # Two newlines
                \D+                         # 1 or more non-digits
                storeU=(\d+\.\d+)           # Decimal-number
                \s
                uIx=(\d+)                   # Fetch uIx-variable
                \s
                storeI=(-?\d+.\d+)          # Fetch storeI-variable
                \s
                iIx=(\d+)                   # Fetch iIx-variable
                \s
                avgCI=(-?\d+.\d+)           # Fetch avgCI-variable
                """, re.VERBOSE | re.MULTILINE)

file_times = open("output_times.txt","w")
for match in pattern_meas.finditer(text):
    output = "%s,\t%s,\t\t%s,\t%s,\t\t%s,\t%s\n" % (match.group(1), match.group(2), match.group(3), match.group(4), match.group(5), match.group(6))
    file_times.write(output)
file_times.close()

Vielleicht kann es aber kompakter und pythonischer geschrieben werden ....