, поскольку даже не вариантный набор As может содержать только Bs, если
очень интересностатья об архитектуре коллекций Scala 2.8 и я немного экспериментировал с этим. Для начала я просто скопировал окончательный кодRNA
пример. Вот это для справки:
abstract class Base
case object A extends Base
case object T extends Base
case object G extends Base
case object U extends Base
object Base {
val fromInt: Int => Base = Array(A, T, G, U)
val toInt: Base => Int = Map(A -> 0, T -> 1, G -> 2, U -> 3)
}
final class RNA private (val groups: Array[Int], val length: Int)
extends IndexedSeq[Base] with IndexedSeqLike[Base, RNA] {
import RNA._
// Mandatory re-implementation of `newBuilder` in `IndexedSeq`
override protected[this] def newBuilder: Builder[Base, RNA] =
RNA.newBuilder
// Mandatory implementation of `apply` in `IndexedSeq`
def apply(idx: Int): Base = {
if (idx < 0 || length <= idx)
throw new IndexOutOfBoundsException
Base.fromInt(groups(idx / N) >> (idx % N * S) & M)
}
// Optional re-implementation of foreach,
// to make it more efficient.
override def foreach[U](f: Base => U): Unit = {
var i = 0
var b = 0
while (i < length) {
b = if (i % N == 0) groups(i / N) else b >>> S
f(Base.fromInt(b & M))
i += 1
}
}
}
object RNA {
private val S = 2 // number of bits in group
private val M = (1 << S) - 1 // bitmask to isolate a group
private val N = 32 / S // number of groups in an Int
def fromSeq(buf: Seq[Base]): RNA = {
val groups = new Array[Int]((buf.length + N - 1) / N)
for (i <- 0 until buf.length)
groups(i / N) |= Base.toInt(buf(i)) << (i % N * S)
new RNA(groups, buf.length)
}
def apply(bases: Base*) = fromSeq(bases)
def newBuilder: Builder[Base, RNA] =
new ArrayBuffer mapResult fromSeq
implicit def canBuildFrom: CanBuildFrom[RNA, Base, RNA] =
new CanBuildFrom[RNA, Base, RNA] {
def apply(): Builder[Base, RNA] = newBuilder
def apply(from: RNA): Builder[Base, RNA] = newBuilder
}
}
Теперь вот моя проблема. Если я запускаю это, все в порядке:
val rna = RNA(A, G, T, U)
println(rna.map(e => e)) // prints RNA(A, G, T, U)
но этот код превращает РНК в вектор!
val rna: IndexedSeq[Base] = RNA(A, G, T, U)
println(rna.map(e => e)) // prints Vector(A, G, T, U)
Это проблема, так как клиентский код не знает оRNA
класс может преобразовать его обратно вVector
вместо этого, когда только отображение изBase
вBase
, Почему это так, и как это исправить?
П.С .: Я нашел предварительный ответ (см. Ниже), пожалуйста, поправьте меня, если я ошибаюсь.