, так что это будет не очень эффективно.

ель - объединить столбцы в кадре данных (источник) на основе пар, которые описаны в отдельном кадре данных (ссылка). Результирующий кадр данных должен заменить заголовки столбцов в источнике на метки индекса в справочнике.

Фрейм данных, используемый для ссылок, выглядит следующим образом:
df1 = pd.DataFrame(dict(
    FIRST=['Alpha', 'Alpha', 'Charlie'],
    SECOND=['Bravo', 'Delta', 'Delta']
), ['H1', 'H2', 'H3'])

df1

      FIRST SECOND
H1    Alpha  Bravo
H2    Alpha  Delta
H3  Charlie  Delta
Фрейм данных, используемый в качестве источника данных:
df2 = pd.DataFrame(dict(
    Alpha=['A', 'C'],
    Bravo=['A', 'C'],
    Delta=['T', 'C'],
    Charlie=['T', 'G']
), ['item-000', 'item-111'])

df2

           Alpha Bravo Charlie Delta
item-000     A     A       T     T
item-111     C     C       G     C
Как будет выглядеть итоговый кадр данных:
          H1  H2  H3
item-000  AA  AT  TT
item-111  CC  CC  GC

Вопрос
Возможно ли это с текущей настройкой, или было бы лучше изменить форму, в которой находятся данные?

Ответы на вопрос(2)

Ваш ответ на вопрос