Можем ли мы сделать прогноз с помощью nlxb из пакета nlmrt?
Я задаю этот вопрос, потому что я не мог понять, почемуnlxb
Функция подгонки не работает с функцией предиката ().
Я искал, чтобы решить эту проблему, но пока не повезло :(
я используюdplyr
группировать данные и использоватьdo
чтобы соответствовать каждой группе, используяnlxb
отnlmrt
пакет.
Вот моя попытка
set.seed(12345)
set =rep(rep(c("1","2","3","4"),each=21),times=1)
time=rep(c(10,seq(100,900,100),seq(1000,10000,1000),20000),times=1)
value <- replicate(1,c(replicate(4,sort(10^runif(21,-6,-3),decreasing=FALSE))))
data_rep <- data.frame(time, value,set)
> head(data_rep)
# time value set
#1 10 1.007882e-06 1
#2 100 1.269423e-06 1
#3 200 2.864973e-06 1
#4 300 3.155843e-06 1
#5 400 3.442633e-06 1
#6 500 9.446831e-06 1
* * * *
library(dplyr)
library(nlmrt)
d_step <- 1
f <- 1e9
d <- 32
formula = value~Ps*(1-exp(-2*f*time*exp(-d)))*1/(sqrt(2*pi*sigma))*exp(-(d-d_ave)^2/(2*sigma))*d_step
dffit = data_rep %>% group_by(set) %>%
do(fit = nlxb(formula ,
data = .,
start=c(d_ave=44,sigma=12,Ps=0.5),
control=nls.lm.control(maxiter = 100),
trace=TRUE))
-------------------------------------------------- ------Есть два момента, которые я хотел бы получить, наконец,
1) Во-первых, как получить подгоночные коэффициенты каждой группы в продолжениеdffit
трубопровод.
2) Делать прогноз на основе новых значений х.
напримерrange <- data.frame(x=seq(1e-5,20000,length.out=10000))
предсказать (подходит, data.frame (х = диапазон)
Error in UseMethod("predict") :
no applicable method for 'predict' applied to an object of class "nlmrt"
посколькуnlxb
работает гладко по сравнению сnls
г-MINPACK-lmnls-лм-не удалось-с-топ-результатов Я бы предпочел решения сnlxb
, Но если у вас есть лучшее решение, пожалуйста, сообщите нам.