R ggplot2: используя stat_summary (среднее) и логарифмическую шкалу

У меня есть куча измерений с течением времени, и я хочу построить их в R. Вот пример моих данных. У меня есть 6 измерений для каждого из 4 временных моментов:

values <- c (1012.0, 1644.9, 837.0, 1200.9, 1652.0, 981.5, 
    2236.9, 1697.5, 2087.7, 1500.8,
    2789.3, 1502.9, 2051.3, 3070.7, 3105.4, 
    2692.5, 1488.5, 1978.1, 1925.4, 1524.3,
    2772.0, 1355.3, 2632.4, 2600.1)
time <- factor (rep (c(0, 12, 24, 72), c(6, 6, 6, 6)))

Масштаб этих данных является произвольным, и на самом деле я собираюсь его нормализовать, чтобы среднее значение t = 0 равнялось 1.

norm <- values / mean (values[time == 0])

Все идет нормально. С помощьюggplotЯ рисую как отдельные точки, так и линию, которая проходит через среднее значение в каждой временной точке:

require (ggplot2)
p <- ggplot(data = data.frame(time, norm), mapping = aes (x = time, y = norm)) +
    stat_summary (fun.y = mean, geom="line", mapping = aes (group = 1)) +
    geom_point()

Однако теперь я хочу применить логарифмическую шкалу, и именно здесь начинаются мои проблемы. Когда я делаю:

q <- ggplot(data = data.frame(time, norm), mapping = aes (x = time, y = norm)) +
    stat_summary (fun.y = mean, geom="line", mapping = aes (group = 1)) +
    geom_point() + 
    scale_y_log2()

Линия НЕ проходит через 0 при t = 0, как и следовало ожидать, потому что log (1) == 0. Вместо этого линия пересекает ось Y немного ниже 0. Очевидно,ggplot применяет среднеепосле преобразование журнала, которое дает другой результат. Я хочу, чтобы это означалодо преобразование журнала.

Как я могу сказатьggplot сначала применить среднее? Есть ли лучший способ создать этот график?

Ответы на вопрос(3)

Ваш ответ на вопрос