Я пытаюсь скомпилировать оболочку Python для небольшой библиотеки C ++, которую я написал. Я написал следующееsetup.py скрипт, чтобы попытаться использоватьsetuptools скомпилировать оболочку:

from setuptools import setup, Extension
import numpy as np
import os

atmcmodule = Extension(
    'atmc',
    include_dirs=[np.get_include(), '/usr/local/include'],
    libraries=['mcopt', 'c++'],  # my C++ library is at ./build/libmcopt.a
    library_dirs=[os.path.abspath('./build')],
    sources=['atmcmodule.cpp'],
    language='c++',
    extra_compile_args=['-std=c++11', '-v'],
    )

setup(name='tracking',
      version='0.1',
      description='Particle tracking and MC optimizer module',
      ext_modules=[atmcmodule],
      )

Тем не менее, когда я бегуpython setup.py build на OS X El Capitan,clang жалуется на отсутствие некоторых стандартных заголовков библиотеки C ++:

In file included from atmcmodule.cpp:7:
In file included from ./mcopt.h:11:
In file included from ./arma_include.h:4:
/usr/local/include/armadillo:54:12: fatal error: 'initializer_list' file not found
  #include <initializer_list>
           ^
1 error generated.
error: command 'gcc' failed with exit status 1

Проходя-v Флаг компилятора показывает, что он ищет следующие пути включения:

#include <...> search starts here:
 /Users/[username]/miniconda3/include
 /Users/[username]/miniconda3/lib/python3.4/site-packages/numpy/core/include
 /usr/local/include
 /Users/[username]/miniconda3/include/python3.4m
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/usr/include/c++/4.2.1
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/usr/include/c++/4.2.1/backward
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../lib/clang/7.0.0/include
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/include
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/usr/include
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/System/Library/Frameworks (framework directory)
End of search list.

Это, очевидно, не включает путь к заголовкам стандартной библиотеки C ++. Если я скомпилирую небольшой исходный код C ++ с-v вариант, я вижу, чтоclang++ обычно также ищет путь/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../include/c++/v1и если я включу этот путь вinclude_dirs вариант дляExtension в моемsetup.py скрипт, тогда модуль расширения правильно компилируется и работает. Однако жесткое программирование этого пути в сценарии не кажется хорошим решением, так как этот модуль также должен работать в Linux.

Итак, мой вопроскак правильно сделатьsetuptools включить необходимые заголовки?

Обновление (22.11.2015)

Какsetuptools пытается скомпилировать расширение, оно печатает первую команду, которую оно выполняет:

gcc -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I/Users/[username]/miniconda3/include -arch x86_64 -I/Users/[username]/miniconda3/lib/python3.4/site-packages/numpy/core/include -I/Users/[username]/Documents/Code/ar40-aug15/monte_carlo/mcopt -I/usr/local/include -I/Users/[username]/miniconda3/include/python3.4m -c /Users/[username]/Documents/Code/ar40-aug15/monte_carlo/atmc/atmcmodule.cpp -o build/temp.macosx-10.5-x86_64-3.4/Users/[username]/Documents/Code/ar40-aug15/monte_carlo/atmc/atmcmodule.o -std=c++11 -fopenmp -v

Если я вставляю эту команду в терминал и запускаю ее самостоятельно, расширение успешно компилируется. Так что я подозреваю, что либоsetuptools изменяет некоторые переменные окружения, о которых я не знаю, или лжет о командах, которые он на самом деле выполняет.