Например, у меня есть http-сервер, который является node.js, поэтому не является блокирующим.

Для каждого запроса сделаем операцию БД.

что я не могу понять, так это то, что разница между блокирующей операцией БД и неблокирующей операцией БД?

Поскольку веб-сервер неблокирующий, блокирующая операция БД внутри запроса не имеет значения?