R fast cbind mat, rix с использованием Rcpp
cbind
в R относительно много времени при повторных вызовах, но это также мощный для различных типов данных. Я написал код, который в 3 раза быстрее, чемcbind
при связывании двух матриц. Ноbind_cols
вdplyr
пакет просто в 100 раз быстрее, чемcbind
, Жаль только, что он не может принимать матрицу в качестве входных данных. Может кто-нибудь сделать код ниже более быстрым. Кроме того, как я могу быстро связать разреженную матрицу? Вот код, который я использовал:
require( Rcpp )
func <- 'NumericMatrix mmult(NumericMatrix a,NumericMatrix b) {
//the colnumber of first matrix
int acoln=a.ncol();
//the colnumber of second matrix
int bcoln=b.ncol();
//build a new matrix, the dim is a.nrow() and acoln+bcoln
NumericMatrix out(a.nrow(),acoln+bcoln) ;
for (int j = 0; j < acoln + bcoln; j++) {
if (j < acoln) {
out(_,j) = a(_,j);
} else {
//put the context in the second matrix to the new matrix
out(_,j) = b(_,j-acoln);
}
}
return out ;
}'
a <- matrix(rep(1,2000*100),2000)
b <- matrix(rep(2,2000*10),2000)
cppFunction(func)
system.time(for (i in seq(1,800)) {mmult(a,b)})
system.time(for (i in seq(1,800)) {cbind(a,b)})
identical(mmult(a,b),cbind(a,b))