График NetworkX Graph из матрицы смежности в CSV-файле
Я немного боролся с этой проблемой, я знаю, что это очень просто - но у меня мало опыта работы с Python или NetworkX. Мой вопрос очень прост, я пытаюсь построить большой набор данных (около 200 строк / столбцов) матрицы, которая выглядит следующим образом. Первый ряд и первый столбец идентичны.
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K
A,0,1,1,0,1,1,1,1,0,1,0
B,1,0,0,0,1,1,1,1,0,1,0
C,1,0,0,0,1,1,1,1,0,1,0
Это просто матрица, показывающая, как люди связаны, ивсе, что я хочу, это импортировать и построить этот CSV-файл с соответствующими метками в NetworkX.
У меня есть этот файл (people.cs
v) и глядя на предыдущие ответыВотПохоже, что лучший способ сделать это - поместить данные в массив с помощью numpy.
Кажется, есть проблема с этим:
import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
from numpy import genfromtxt
import numpy as np
mydata = genfromtxt('mouse.csv', delimiter=',')
Я получаю следующий вывод:
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/lib/npyio.py", line 1272, in genfromtxt
fhd = iter(np.lib._datasource.open(fname, 'rbU'))
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/lib/_datasource.py", line 145, in open
return ds.open(path, mode)
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/lib/_datasource.py", line 472, in open
found = self._findfile(path)
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/lib/_datasource.py", line 323, in _findfile
if self.exists(name):
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/lib/_datasource.py", line 417, in exists
from urllib2 import urlopen
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/urllib2.py", line 94, in <module>
import httplib
File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/httplib.py", line 69, in <module>
from array import array
File "/Users/Plosslab/Documents/PythonStuff/array.py", line 4, in <module>
NameError: name 'array' is not defined