Прогноз с ggplot2 и функцией funggcast
Наэтот веб-сайт, г-н Давенпорт опубликовал функцию, чтобы построить прогноз арима сggplot2
на примере произвольного набора данных он опубликовалВот, Я могу следовать его примеру без каких-либо сообщений об ошибках.
Теперь, когда я использую свои данные, я заканчиваю предупреждением:
1: In window.default(x, ...) : 'end' value not changed
2: In window.default(x, ...) : 'end' value not changed
Я знаю, что это происходит, когда я вызываю эту командуpd <- funggcast(yt, yfor)
из-за проблемы с данными, которые я указываю в моих данныхend = c(2013)
, Но я не знаю, как это исправить.
Это код, который я использую:
library(ggplot2)
library(zoo)
library(forecast)
myts <- ts(rnorm(55), start = c(1960), end = c(2013), freq = 1)
funggcast <- function(dn, fcast){
en <- max(time(fcast$mean)) # Extract the max date used in the forecast
# Extract Source and Training Data
ds <- as.data.frame(window(dn, end = en))
names(ds) <- 'observed'
ds$date <- as.Date(time(window(dn, end = en)))
# Extract the Fitted Values (need to figure out how to grab confidence intervals)
dfit <- as.data.frame(fcast$fitted)
dfit$date <- as.Date(time(fcast$fitted))
names(dfit)[1] <- 'fitted'
ds <- merge(ds, dfit, all.x = T) # Merge fitted values with source and training data
# Extract the Forecast values and confidence intervals
dfcastn <- as.data.frame(fcast)
dfcastn$date <- as.Date(as.yearmon(row.names(dfcastn)))
names(dfcastn) <- c('forecast','lo80','hi80','lo95','hi95','date')
pd <- merge(ds, dfcastn,all.x = T) # final data.frame for use in ggplot
return(pd)
}
yt <- window(myts, end = c(2013)) # extract training data until last year
yfit <- auto.arima(myts) # fit arima model
yfor <- forecast(yfit) # forecast
pd <- funggcast(yt, yfor) # extract the data for ggplot using function funggcast()
ggplot(data = pd, aes(x = date,y = observed)) + geom_line(color = "red") + geom_line(aes(y = fitted), color = "blue") + geom_line(aes(y = forecast)) + geom_ribbon(aes(ymin = lo95, ymax = hi95), alpha = .25) + scale_x_date(name = "Time in Decades") + scale_y_continuous(name = "GDP per capita (current US$)") + theme(axis.text.x = element_text(size = 10), legend.justification=c(0,1), legend.position=c(0,1)) + ggtitle("Arima(0,1,1) Fit and Forecast of GDP per capita for Brazil (1960-2013)") + scale_color_manual(values = c("Blue", "Red"), breaks = c("Fitted", "Data", "Forecast"))
Редактировать: Я нашел другой блогВот с функцией для использования сforecast
а такжеggplot2
но я бы хотел использовать описанный выше подход, если бы смог найти свою ошибку. Кто-нибудь?
Edit2: Если я запускаю ваш обновленный код с моими даннымиВот, чем я получаю график внизу. Обратите внимание, что я не изменилend = c(2023)
заmtys
иначе он не слился бы с прогнозируемым значением.
myts <- ts(WDI_gdp_capita$Brazil, start = c(1960), end = c(2023), freq = 1)
funggcast <- function(dn, fcast){
en <- max(time(fcast$mean)) # Extract the max date used in the forecast
# Extract Source and Training Data
ds <- as.data.frame(window(dn, end = en))
names(ds) <- 'observed'
ds$date <- as.Date(time(window(dn, end = en)))
# Extract the Fitted Values (need to figure out how to grab confidence intervals)
dfit <- as.data.frame(fcast$fitted)
dfit$date <- as.Date(time(fcast$fitted))
names(dfit)[1] <- 'fitted'
ds <- merge(ds, dfit, all = T) # Merge fitted values with source and training data
# Extract the Forecast values and confidence intervals
dfcastn <- as.data.frame(fcast)
dfcastn$date <- as.Date(paste(row.names(dfcastn),"01","01",sep="-"))
names(dfcastn) <- c('forecast','lo80','hi80','lo95','hi95','date')
pd <- merge(ds, dfcastn,all.x = T) # final data.frame for use in ggplot
return(pd)
} # ggplot function by Frank Davenport
yt <- window(myts, end = c(2013)) # extract training data until last year
yfit <- auto.arima(yt) # fit arima model
yfor <- forecast(yfit) # forecast
pd <- funggcast(myts, yfor) # extract the data for ggplot using function funggcast()
ggplot(data = pd, aes(x = date, y = observed)) + geom_line(color = "red") + geom_line(aes(y = fitted), color = "blue") + geom_line(aes(y = forecast)) + geom_ribbon(aes(ymin = lo95, ymax = hi95), alpha = .25) + scale_x_date(name = "Time in Decades") + scale_y_continuous(name = "GDP per capita (current US$)") + theme(axis.text.x = element_text(size = 10), legend.justification=c(0,1), legend.position=c(0,1)) + ggtitle("Arima(0,1,1) Fit and Forecast of GDP per capita for Brazil (1960-2013)") + scale_color_manual(values = c("Blue", "Red"), breaks = c("Fitted", "Data", "Forecast")) + ggsave((filename = "gdp_forecast_ggplot.pdf"), width=330, height=180, units=c("mm"), dpi = 300, limitsize = TRUE)
Почти идеальный график, который я получаю:
Еще один вопрос: как я могу получить легенду на этом графике?
Если я установлюend = c(2013)
заmyts
Я получаю тот же график, что и в начале: