Одним из таких случаев является чтение int из Bundle и сохранение его в переменной, ограниченной аннотацией @IndDef:

public class MainActivity extends ActionBarActivity {

@IntDef({STATE_IDLE, STATE_PLAYING, STATE_RECORDING})
@Retention(RetentionPolicy.SOURCE)
public @interface State {}

public static final int STATE_IDLE = 0;
public static final int STATE_PLAYING = 1;
public static final int STATE_RECORDING = 2;

@MainActivity.State int fPlayerState = STATE_IDLE;

@Override
protected void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
    super.onCreate(savedInstanceState);

    if (savedInstanceState != null)
        fPlayerState = savedInstanceState.getInt(BUNDLE_STATE); //Causes "Must be one of: ..." error

Должен быть какой-то способ подавить проверку или приведение от int к @ MainActivity.State int, чтобы установить переменную в последней строке.

Другой случай - написать отрицательный тест, который вызывает функцию с аннотированным параметром, преднамеренно передавая неправильный параметр, чтобы проверить, что в этом случае выбрасывается исключение. Должен быть способ подавить проверку аннотации, чтобы скомпилировать такой тест.