На этот вопрос уже есть ответ здесь:

Добрый день, у меня есть набор данных, который я получил из текстового файла

> MyData
   Xdat Ydat
1  1    12
2  2    23
3  3    34
4  4    45
5  5    56
6  6    67
7  7    78

Мне нужно использовать этот набор для извлечения строк, которые соответствуют случаю, когда 2-й столбец (Ydat) больше 40. В результате MyData2

   Xdat Ydat
4  4    45
5  5    56
6  6    67
7  7    78