Я планирую три набора примерно из 20 временных рядов. Каждый временной ряд имеет 1,8 миллиона точек, и я строю их отдельно. Чтобы сократить время выполнения (поскольку я обнаружил, что функция figure () довольно трудоемка), я открываю только одну фигуру, строю график и затем очищаю ее для следующего временного ряда. Что-то вроде:

import matplotlib.pyplot as plt

fig = plt.figure() # open a figure for plotting
for v in range(nfigs):
    # here I build the x and y vectors from the raw data
    # and also the figname string
    plt.plot(x, y, linewidth=0.3)
    plt.title('a title')
    plt.xlabel('x-label')
    plt.ylabel('y-label')
    plt.grid()
    plt.draw()
    plt.savefig(figname)
    plt.clf()
plt.close() # close the figure after the job is done

Все графики сохранены в порядке, кроме одного, в частности, во всех наборах данных, который дает мне следующую ошибку (отредактировал пути к файлам для конфиденциальности):

Traceback (most recent call last):
  File "", line 1, in 
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\spyderlib\widgets\externalshell\sitecustomize.py", line 540, in runfile
    execfile(filename, namespace)
  File "batch.py", line 142, in 
    main(fn)
  File "batch.py", line 94, in main
    plt.savefig(figname+'_'+nn+'.png')
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\pyplot.py", line 561, in savefig
    return fig.savefig(*args, **kwargs)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\figure.py", line 1421, in savefig
    self.canvas.print_figure(*args, **kwargs)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\backends\backend_qt4agg.py", line 167, in print_figure
    FigureCanvasAgg.print_figure(self, *args, **kwargs)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\backend_bases.py", line 2220, in print_figure
    **kwargs)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\backends\backend_agg.py", line 505, in print_png
    FigureCanvasAgg.draw(self)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\backends\backend_agg.py", line 451, in draw
    self.figure.draw(self.renderer)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\artist.py", line 55, in draw_wrapper
    draw(artist, renderer, *args, **kwargs)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\figure.py", line 1034, in draw
    func(*args)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\artist.py", line 55, in draw_wrapper
    draw(artist, renderer, *args, **kwargs)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\axes.py", line 2086, in draw
    a.draw(renderer)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\artist.py", line 55, in draw_wrapper
    draw(artist, renderer, *args, **kwargs)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\lines.py", line 562, in draw
    drawFunc(renderer, gc, tpath, affine.frozen())
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\lines.py", line 938, in _draw_lines
    self._lineFunc(renderer, gc, path, trans)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\lines.py", line 978, in _draw_solid
    renderer.draw_path(gc, path, trans)
  File "~\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\matplotlib\backends\backend_agg.py", line 145, in draw_path
    self._renderer.draw_path(gc, path, transform, rgbFace)
OverflowError: Allocated too many blocks

Временные ряды, которые вызывают эту ошибку, не имеют абсолютно ничего особенного, я проверил это с помощью простой функции show () вместо savefig (). Это не первый и не последний (примерно в 60 временных рядах), но этого достаточно, чтобы сломать мой сценарий. Помощь в этом очень ценится!