Resultados da pesquisa a pedido "hdf5"
Como ler arquivos HDF5 em Python
Estou tentando ler dados do arquivo hdf5 em Python. Eu posso ler o arquivo hdf5 usandoh5py, mas não consigo descobrir como acessar dados no arquivo. Meu códigoimport h5py import numpy as np f1 = h5py.File(file_name,'r+')Isso funciona e o arquivo ...
Existe uma vantagem de velocidade de análise ou uso de memória no uso do HDF5 para armazenamento em grandes matrizes (em vez de arquivos binários simples)?
Estou processando grandes matrizes 3D, que muitas vezes preciso dividir de várias maneiras para fazer uma variedade de análises de dados. Um "cubo" típico pode ter ~ 100 GB (e provavelmente aumentará no futuro) Parece que o formato de arquivo ...
O arquivo HDF5 criado com o h5py não pode ser aberto pelo h5py
Criei um arquivo HDF5 aparentemente sem problemas, no Ubuntu 12.04 (versão 32 bits), usando o Anaconda como distribuição Python e escrevendo em notebooks ipython. Os dados subjacentes são todos matrizes numpy. Por exemplo, import numpy as np ...
IOError: Não é possível ler dados (Não é possível abrir o diretório) - Filtro de compactação gzip ausente
Eu nunca trabalhei com arquivos HDF5 antes e, para começar, recebi alguns arquivos de exemplo. Estive verificando todos os conceitos básicos comh5py, observando os diferentes grupos nesses arquivos, seus nomes, chaves, valores e assim por diante. ...
Erro de construção de C ++ para um código simples usando as bibliotecas armadillo e hdf5
Eu sou bastante novo em C ++ e tatu, e fico com um erro de construção descrito abaixo. Estou tentando testar o seguinte código simples para salvar uma matriz de tatu como arquivo hdf5: #include <iostream> #include <armadillo> using namespace ...
ImportError HDFStore requer PyTables Nenhum módulo chamado tabelas
import pandas as pd dfs = pd.HDFStore('xxxxx.h5')lança este erro: "ImportError: HDFStore requires PyTables, "No module named tables" problem importing" Eu tentei instalar o PyTables, que requer o Cython. Eu tenho o Cython 0.21 instalado, mas ...
gravações incrementais em hdf5 com h5py
Eu tenho uma pergunta sobre a melhor forma de gravar em arquivos hdf5 com python / h5py. Eu tenho dados como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 ...
Python (pandas): armazena um quadro de dados em hdf5 com um índice múltiplo
Eu preciso trabalhar com um quadro de dados de grande dimensão com vários índices, então tentei criar um quadro de dados para aprender como armazená-lo em um arquivo hdf5. O quadro de dados é assim: (com o multi-índice nas 2 ...
Como copiar parcialmente usando python um arquivo Hdf5 em um novo mantendo a mesma estrutura?
Eu tenho um arquivo hdf5 grande que se parece com isso: A/B/dataset1, dataset2 A/C/dataset1, dataset2 A/D/dataset1, dataset2 A/E/dataset1, dataset2... Quero criar um novo arquivo apenas com isso: A / B / conjunto de dados1, conjunto de dados2 A ...
HDF5 rowmajor ou colmajor
É possível saber se uma matriz armazenada no formato HDF5 está no RowMajor ou no ColMajor? Por exemplo, quando eu salvo matrizes da oitava, que as armazena internamente como ColMajor, preciso transpor quando leio no código C, onde as matrizes são ...