Resultados da pesquisa a pedido "awk"

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Comprimento da sequência do arquivo FASTA

Eu tenho o seguinte arquivo FASTA: >header1 CGCTCTCTCCATCTCTCTACCCTCTCCCTCTCTCTCGGATAGCTAGCTCTTCTTCCTCCT TCCTCCGTTTGGATCAGACGAGAGGGTATGTAGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGC >header2 GGT >header3 TTATGATMinha saída desejada: >header1 117 >header2 3 ...

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Como combinar 2 arquivos csv + todo o conteúdo + cygwin / bash / awk / sed / paste

Como combinar 2 arquivos CSV (finle1.csv e file2.csv)? Eu explorei o awk / sed / paste, mas está além de mim. file1.csv Time,Object,Integrity,KPI 1-A Name A unit(unit/s),KPI 2-A Name B unit(unit/s) 2014-06-04 11:00,ObjectA,100%,0.0316,0.0012 ...

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como grep a última ocorrência do padrão de linha

Eu tenho um arquivo com conteúdo, x a x b x cQuero saudar a última ocorrência, x cquando eu tento sed -n "/x/,/b/p" filelista todas as linhas. começando x para c

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Mesclar vários arquivos CSV awk em colunas, sem correspondência

Tenho certeza de que isso é óbvio e provavelmente já foi perguntado, mas eu tenho procurado por isso agora. Sinto muito pela pergunta idiota! Eu quero mesclarmúltiploArquivos CSV: Arquivo1 A, B A, B A, BArquivo2 C C CArquivo3 D D De eu quero ...

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awk ou perl one-liner para imprimir linha se o segundo campo for maior que 7 caracteres

Eu tenho um arquivo de 1000 linhas, cada linha tem 2 palavras, separadas por um espaço. Como imprimir cada linha somente se o comprimento da última palavra for maior que 7 caracteres? Posso usar o awk RLENGTH? existe uma maneira fácil em perl?

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O manuseio do awk CR LF quebra no cygwin?

No Linux, isso é executado conforme o esperado: $ echo -e "line1\r\nline2"|awk -v RS="\r\n" '/^line/ {print "awk: "$0}' awk: line1 awk: line2Mas no Windows o \ r é descartado (o awk considera esta linha): Janelas: $ echo -e ...

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'Alias' do Unix falha com o comando 'awk'

Estou criando um alias no Unix e descobri que o seguinte comando falha .. alias logspace='find /apps/ /opt/ -type f -size +100M -exec ls -lh {} \; | awk '{print $5, $9 }''Eu recebo o seguinte: awk: cmd. line:1: {print awk: cmd. line:1: ^ ...

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Limitações do grep / awk stdin

Olhei em volta, mas não consigo encontrar alguém que já tenha respondido a isso. Estou escrevendo um script bash que irá ler 6 diferentescsv arquivos e conte quantas linhas em todos os arquivos possuem determinadas tags. (é um banco de dados da ...

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Sed ou awk para substituir uma linha em um bloco

O arquivo de entrada contém: [abc] para1=123 para2=456 para3=111 [pqr] para1=333 para2=765 para3=1345 [xyz] para1=888 para2=236 para3=964O requisito do script de shell é substituir o parâmetro de um bloco específico Ex: Substituirpara2=765 ...

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No awk, como posso usar um arquivo contendo várias seqüências de formato com printf?

Tenho um caso em que quero usar a entrada de um arquivo como o formato paraprintf() em awk. Minha formatação funciona quando eu a defino em uma sequência dentro do código, mas não funciona quando eu a carrego da entrada. Aqui está um pequeno ...