Transição de um gráfico forçado para outro gráfico em d3js

Eu tenho duas árvores de força dobrável para os mesmos nós.

Não vi um exemplo de que possamos transitar de uma árvore para outra com transição de nós e reconstrução de bordas no d3js.

Existe alguma maneira de fazer isso?

Outra questão relevante, poderíamos inicializar a posição de cada nó para o gráfico de direção forçada?

EDIT: Aqui está umexemplo. Eu tenho duas árvores, o link é um e outra árvore com as mesmas moléculas, mas com estrutura de árvore diferente. Eu estou achando que seria bom se eu pudesse animar entre diferentes árvores para as mesmas moléculas ou entidades.

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