Como executar o código php de file_get_contents ou arquivo em uma função

Estou projetando meu próprio padrão MVC para facilitar o processo de criação de páginas iniciais. Meu sistema de modelos precisa da minha classe de controlador para exibir minhas visualizações. Isso significa que eu tenho que enviar o arquivo através de uma função php. Estou pesquisando há algum tempo e não consigo encontrar uma solução.

Como posso, através de uma função PHP, executar uma string representando algum código-fonte ("<?", "<? Php", "?>" E assim por diante) como php? Eval não levaria meu <? sinais (e eu li que essa função é péssima por algum motivo

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