Eu recebo a seguinte exceção:

Exception in thread "main" org.hibernate.LazyInitializationException: could not initialize proxy - no Session
    at org.hibernate.proxy.AbstractLazyInitializer.initialize(AbstractLazyInitializer.java:167)
    at org.hibernate.proxy.AbstractLazyInitializer.getImplementation(AbstractLazyInitializer.java:215)
    at org.hibernate.proxy.pojo.javassist.JavassistLazyInitializer.invoke(JavassistLazyInitializer.java:190)
    at sei.persistence.wf.entities.Element_$$_jvstc68_47.getNote(Element_$$_jvstc68_47.java)
    at JSON_to_XML.createBpmnRepresantation(JSON_to_XML.java:139)
    at JSON_to_XML.main(JSON_to_XML.java:84)

quando tento ligar das principais linhas a seguir:

Model subProcessModel = getModelByModelGroup(1112);
System.out.println(subProcessModel.getElement().getNote());

Eu implementei ogetModelByModelGroup(int modelgroupid) método primeiramente como este:

    public static Model getModelByModelGroup(int modelGroupId, boolean openTransaction) {

        Session session = SessionFactoryHelper.getSessionFactory().getCurrentSession();     
        Transaction tx = null;

        if (openTransaction)
            tx = session.getTransaction();

        String responseMessage = "";

        try {
            if (openTransaction)            
                tx.begin();
            Query query = session.createQuery("from Model where modelGroup.id = :modelGroupId");
            query.setParameter("modelGroupId", modelGroupId);
            @SuppressWarnings("unchecked")
            List<Model> modelList = (List<Model>)query.list(); 
            Model model = null;
            // Cerco il primo Model che è in esercizio: idwf_model_type = 3
            for (Model m : modelList)
                if (m.getModelType().getId() == 3) {
                    model = m;
                    break;
                }

            if (model == null) {
                Object[] arrModels = modelList.toArray();
                if (arrModels.length == 0) 
                    throw new Exception("Non esiste ");

                model = (Model)arrModels[0];
            }

            if (openTransaction)
                tx.commit();
            return model;

        } catch(Exception ex) {
            if (openTransaction)
                tx.rollback();
            ex.printStackTrace();
            if (responseMessage.compareTo("") == 0)
                responseMessage = "Error" + ex.getMessage();
            return null;        
        }

e conseguiu a exceção. Então, um amigo me sugeriu que sempre testasse a sessão e obtivesse a sessão atual para evitar esse erro. Então eu fiz isso:

public static Model getModelByModelGroup(int modelGroupId) {

        Session session = null;
        boolean openSession = session == null;
        Transaction tx = null;
        if (openSession){
          session = SessionFactoryHelper.getSessionFactory().getCurrentSession();   
            tx = session.getTransaction();
        }
        String responseMessage = "";

        try {
            if (openSession)            
                tx.begin();
            Query query = session.createQuery("from Model where modelGroup.id = :modelGroupId");
            query.setParameter("modelGroupId", modelGroupId);
            @SuppressWarnings("unchecked")
            List<Model> modelList = (List<Model>)query.list(); 
            Model model = null;
            for (Model m : modelList)
                if (m.getModelType().getId() == 3) {
                    model = m;
                    break;
                }

            if (model == null) {
                Object[] arrModels = modelList.toArray();
                if (arrModels.length == 0) 
                    throw new RuntimeException("Non esiste");

                model = (Model)arrModels[0];

            if (openSession)
                tx.commit();
            return model;

        } catch(RuntimeException ex) {
            if (openSession)
                tx.rollback();
            ex.printStackTrace();
            if (responseMessage.compareTo("") == 0)
                responseMessage = "Error" + ex.getMessage();
            return null;        
        }

    }

mas ainda assim recebe o mesmo erro. Tenho lido muito sobre esse erro e encontrei algumas soluções possíveis. Um deles era definir lazyLoad como false, mas não tenho permissão para fazer isso, por isso me sugeriram controlar a sessão