Isso está relacionado a outro pergunta eu perguntei recentemente

Ao instalar o msysgit, o instalador apresenta 3 opções relacionadas ao caminho do sistema:

Nunca mude o ambiente do Windows. Com esta opção, você precisa usar o shell "bash" para trabalhar com o git.

Adicione o diretório git \ bin à variável de ambiente PATH, mas sem substituir algumas ferramentas internas do Windows. Companheiro stackoverflow-ian Gabe Moothart me disse em um comentário que esta opção fará com que algumas operações do git falhem! Quais são essas operações? Devo me preocupar com eles?

Same as 2, mas substitua algumas ferramentas padrão do sistema. Quais são essas ferramentas? Quais partes das janelas dependem delas? e isso vai doer na prática?

Outra questão me veio à mente, não relacionada ao PATH do sistem

E se eu tiver links simbólicos e hard links dentro do diretório do meu projeto? O git sabe como lidar com isso? ou sofrerá uma recursão infinita, se, por exemplo, a estrutura de diretórios for tal que alguma pasta seja realmente um link simbólico para um de seus pai