Empurrando apenas uma pasta para o repositório remoto

Estou usando o Git 1.7.4.1. Quero enviar confirmações que fiz em uma pasta para meu repositório remoto. Como envio apenas alterações de uma pasta para meu repositório remoto? Toda a documentação que encontrei lista apenas como enviar todo o repositório ...

davea-mbp2:systems davea$ git push origin trunk
Password: 
To http://[email protected]/systems.git
 ! [rejected]        trunk -> trunk (non-fast-forward)
error: failed to push some refs to 'http://[email protected]/systems.git'
To prevent you from losing history, non-fast-forward updates were rejected
Merge the remote changes (e.g. 'git pull') before pushing again.  See the
'Note about fast-forwards' section of 'git push --help' for details.

Os conflitos sobre os quais estou sendo avisado não se aplicam à pasta que desejo enviar. Qualquer ajuda é apreciada, - Dave

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