Como dinamizar um dataframe com pandas corretamente

Tenho um dataframe df1 parecido com este

                     rootID   parentID    jobID  time
                  0    A         A          B    2019-01-30 14:33:21.339469
                  1    A         A          C    2019-01-30 14:33:21.812381
                  2    A         C          D    2019-01-30 15:33:21.812381
                  3    E         E          F    2019-01-30 15:33:21.812381
                  4    E         F          G    2019-01-30 16:33:21.812381
                  5    E         F          H    2019-01-30 17:33:21.812381
                  6    E         G          I    2019-01-30 18:33:21.812381

Quero dinamizar esse quadro de dados para o seguinte formulário (df2)

                     rootID   subID1      subID2   subID3  #subFlows
                  0    A         B                             1
                  1    A         C          D                  2  
                  3    E         F          G         I        3
                  4    E         F          H                  2

Eu tente

         df2 = (df1.assign(g=df.groupby('rootID').cumcount().add(1))
               .pivot('rootID','g','jobID')
               .add_prefix('subID')
               .fillna("")
               .reset_index())

          df2['#subFlows'] = (df2 != "").sum(axis=1).astype(int).sub(1)

Que retorna um quadro de dados como

                     rootID   subID1      subID2   subID3 
                  0    A         B          C        D    
                  1    E         F          G        H    

Mas quero, como descrito acima, separar os subIDs não aninhado

Alguma idéia de como eu faria isso?

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