Eu instalei recentementepybedtools no meu ambiente Conda, usando o comando que eles mencionaram -

conda install -c bioconda pybedtools

Mas então, quando eu ativei o spyder neste ambiente, e tentei correrimport pybedtools isso me deu o erro

Modulenotfounderror: no module named 'pybedtools'

Voltei e tentei instalar usando o módulo usandopip também (pip install pybedtools), mas dizia que eu já tinha -

Requirement already satisfied: pybedtools in /anaconda3/envs/env1/lib/python3.5/site-packages Requirement already satisfied: six in ./anaconda3/envs/env1/lib/python3.5/site-packages (from pybedtools)

Portanto, não consigo entender como o módulo está instalado, mas o Spyder não me permite importá-lo. Eu nunca enfrentei esse problema com o Anaconda antes. Qualquer ajuda seria ótimo!