Estou registrando manualmente um subconjunto dos controladores de API da Web do meu projeto:

container.Register(typeof(ILGTWebApiController), controllerType, Lifestyle.Transient); 

Funciona bem. No entanto, quando eu corro:

GlobalConfiguration.Configuration.DependencyResolver = 
    new SimpleInjectorWebApiDependencyResolver(container);

Parece afetartudo Controladores de API da Web no projeto. Eu gostaria de deixar os outros intocados por um simples injetor.

Se eu não executar o código acima, o injector simples reclamará sobre meus controladores não terem um construtor vazio (o que obviamente eles não terão, já que estou usando DI).