Eu tenho uma API Rails e um aplicativo Web (usando express), completamente separados e independentes um do outro. O que eu quero saber é que preciso implantá-los separadamente? Se eu fizer, como posso fazer com que minha API esteja emmysite.com/api e o aplicativo da web emmysite.com/

Eu já vi muitos projetos que fazem dessa maneira, até têm a API e o aplicativo em repositórios separados.