Executar migrações de alambique no Google App Engine

Eu tenho um aplicativo Flask que usa SQLAlchemy (Flask-SQLAlchemy) e Alambique (Flask-Migrate). O aplicativo é executado no Google App Engine. Eu quero usar o Google Cloud SQL.

Na minha máquina, eu corropython manage.py db upgrade para executar minhas migrações no meu banco de dados local. Como o GAE não permite que comandos arbitrários do shell sejam executados, como executo as migrações nele?